قصة فيلم Suzumiya Haruhi no Shoushitsu تدور أحداثها بعد أحداث الأنمي، أي بعد شهر من المهرجان الثقافي. يقوم نادي إس أو إس الذي تقوده هاروهي سوزوميا، بوضع خطط لإقامة حفلة نبيمونو في عيد الميلاد، وفي صباح يوم 18 ديسمبر، يصل كيون إلى المدرسة ويجد أن هاروهي وإتسوكي كويزومي في عداد المفقودين، وقد عادت ريوكو أساكورا بشكل غامض، ميكورو إيساهينا لا تتذكر عنهم أي شيء، ويوكي ناغاتو أصبحت فتاة طبيعية وخجولة، ولا يتذكر أي شخص آخر أي شيء عن هاروهي سوزوميا ولا عن نادي إس أو إس، وكيون هو الشخص الوحيد الذي يتذكرهم.
